努爾哈赤在位期間，是否修建了部分故宮？這在史學界同樣存在很大爭議。 李治亭教授認為，努爾哈赤在沈陽時一直都居住在故宮北門旁邊，而不是居住在沈陽故宮里，這說明當時故宮肯定還沒建完。

　　而且建造宮殿是一項耗資巨大工程，前期準備工作紛繁復雜，而努爾哈赤率部遷都沈陽18個月后便猝然離世。在這么短時間里，根本沒有足夠時間能將復雜的宮殿建造得如此之快。

　　而佟主任則認為，一年半時間也不算太短，在遼陽城建造宮殿時也只用了2年多時間，努爾哈赤在位期間完全有時間修建宮殿。而根據(jù)史料最早記載，1627年正月初一，皇太極在大政殿舉行典禮儀式。按照沈陽的天氣，說明大政殿在1626年10月之前就應該完工。也就是說，在努爾哈赤時期，大政殿和與之成組的建筑十王亭時應該已經(jīng)建好。當然，關(guān)于沈陽故宮的未解之謎還有很多。但李教授強調(diào)，只要能從文化角度來分析解讀故宮，那么這就是皇家宮殿留給后人最重要的一筆文化遺產(chǎn)。