1、難度不同，考駕照的時候自動擋駕駛證的考試難度要比手動擋駕駛證的考試難度低。因為自動擋的車輛是沒有離合踏板的，所以不需要游離配合，操作起來就會比較簡單，因此自動擋駕駛證考試的時候通過率會比手動擋駕駛證考試通過率高一些。

2、費用不同，自動擋的駕駛學車費用普遍要比手動擋的駕駛證學車費用高，主要是由于自動擋的車型比較貴，還有使用和日常的維護方面也花費多。

3、準駕車型不同，手動擋C1駕駛證的準駕車型是小型、微型的載客汽車或載貨汽車，還有小型、微型、輕型的專項作業(yè)車，以及9座以下的一些小型的客車。手動擋C2駕駛證的準駕車型是，小型、微型的自動擋載客或者載貨自動擋汽車。

4、駕照證不同，考手動擋的駕照是C1駕駛證。

考自動擋的是C2駕駛證，C1可以駕駛C2所含車型，C2不能駕駛C1所含車型。

5、擋位不同，自動擋分別有P、R、N、D、3、2、1或L擋位；

手動擋有五個擋位加R擋。

6、考試內容不同：手動擋科目二的考試內容為：倒車入庫、坡道定點停車和起步、側方停車、曲線行駛、直角轉彎；自動擋科目二的考試內容為：倒車入庫、側方停車、曲線行駛、直角轉彎。

依據《機動車駕駛證申領和使用規(guī)定》第三十三條，科目二考試內容包括：

（一）大型客車、重型牽引掛車、城市公交車、中型客車、大型貨車考試樁考、坡道定點停車和起步、側方停車、通過單邊橋、曲線行駛、直角轉彎、通過限寬門、窄路掉頭，以及模擬高速公路、連續(xù)急彎山區(qū)路、隧道、雨（霧）天、濕滑路、緊急情況處置；

（二）小型汽車、低速載貨汽車考試倒車入庫、坡道定點停車和起步、側方停車、曲線行駛、直角轉彎；

（三）小型自動擋汽車、殘疾人專用小型自動擋載客汽車考試倒車入庫、側方停車、曲線行駛、直角轉彎。

對第一款第一項至第三項規(guī)定的準駕車型，省級公安機關交通管理部門可以根據實際增加考試內容。